En mayo del 2023, iniciaron los trabajos de intervención del templo de La Merced, y en noviembre del mismo año fueron suspendidos los trabajos por el Instituto Nacional de Patrimonio Cultural debido que durante la excavación para el piso se encontraron restos humanos y hasta el momento no se ha podido reiniciar los trabajos por parte del contratista responsable.
Desde la fecha de la paralización de los trabajos por el INPC que fue en noviembre del 2023, han pasado 10 meses; según la vicealcaldesa del GAD-Latacunga, Esther Veloz, indicó que el tema dentro de la Fiscalía está solucionado, por lo que, el levantamiento de la paralización para que se retomen los trabajos en el templo está en manos del GAD-Latacunga, quien debe presentar un informe de proyectos arqueológicos solicitado por el Instituto de Patrimonio y que el Municipio ha presentado un informe distinto al solicitado.
Mientras no sea presentado el informe solicitado por el INPC, la obra seguirá paralizada, por lo tanto, la decisión está en manos de las autoridades del Municipio; la Vicealcaldesa, indicó que la fiesta en honor a la santísima virgen de La Merced que se desarrolla el 24 de septiembre, por segundo año consecutivo los actos religiosos deberán seguir realizando fuera del templo.
La paralización de los trabajos por varios meses ha generado malestar, preocupación entre los feligreses, moradores y la ciudadanía en general, porque el templo permanece cerrado, y no saben porque tiempo más, por ello el pedido a los funcionarios y al Alcalde del Municipio de Latacunga, para que solventen lo más pronto posible con la entrega del informe solicitado y en caso de no tener los profesionales respectivos, buscar alternativas para que la obra de intervención sea concluida.
La obra hasta su suspensión de los trabajos según la Vicealcalde, tendría un avance del 64%, la intervención de la estructura de la iglesia está por terminar, restando por realizar el tema de pisos y que seguirá paralizada, mientras el Municipio no entregue el estudio solicitado por el Instituto de Patrimonio.